가상의 작은 마을 스토리브룩에서 이야기가 펼쳐지며, 캐릭터들은 동화 속 인물들과 현실 세계에서의 삶이 얽혀진다는 비밀을 가지고 있다. 시즌 3에서는 스토리브룩 주민들이 자신의 정체성과 과거를 마주하며, 새로운 적들과의 전투와 사랑, 배신 속에서 서로를 지켜나가는 과정을 그린다. 각 인물의 전투와 변화가 중심이 되며, 새로운 동화 속 캐릭터들이 등장해 갈등을 더욱 심화시킨다. 결국, 과거의 상처를 치유하며 진정한 가족과 우정의 의미를 되찾는 여정이 핵심이다.